Distribution géographique des trypanosomoses animales et structure génétique des populations de Trypanosoma .circulant chez les animaux domestiques (bovins et porcins) en Côte d’Ivoire.

Abstract

En Côte d'Ivoire, les trypanosomes animaux dont le plus important, T. congolense représentent un facteur limitant le développement de l’élevage. Cependant, la situation réelle de la trypanosomose animale africaine est méconnue et peu de recherches ont été entreprises sur la génétique des populations et la dynamique de transmission des trpanosomes. Cette étude a permi de déterminer la distribution géographique de la trypanosomose animale africaine en Côte d’Ivoire ; ensuite d’évaluer la diversité et la structure génétique des populations de T. congolense chez les animaux domestiques ; et enfin d’évaluer l’association entre la distribution géographique de T. congolense et ses paramètres génétiques. La méthodologie utilisée a consisté dans un premier temps à investiguer les trypanosomes circulant chez les animaux domestiques de différentes régions de Côte d’Ivoire, en utilisant des outils sérologiques, parasitologiques et moléculaires. Puis à caractériser génétiquement 31 souches de T. congolense provenant des régions Nord, Sud, Est et Centre-Ouest avec cinq marqueurs microsatellites. Et enfin à vérifier l’existence d’une structuration géographique de T. congolense grâce à l’analyse en composante principale et au test de Mantel. Au total, 1473 animaux domestiques dont 741 bovins et 732 porcs provenant de 14 localités dans différentes régions ont été testé. Trois espèces de trypanosomes ont été trouvées dans toutes les localités prospectées dans les proportions suivantes : 9,14 % pour Trypanosoma brucei, 7,60 % pour T. congolense forêt, 5 % pour T. vivax et 2 % pour T. congolense savane. Trypanosoma brucei est majoritaire chez les bovins dans les localités du Nord, et chez les porcs du Centre-Ouest du pays. En ce qui concerne T. congolense forêt, des taux d’infections plus faibles ont été observées chez les bovins en générale. Chez les porcs ce trypanosome est majoritaire dans l’Est du pays et dans le Centre-Ouest. Au niveau de l’infection à T. vivax, les prévalences les plus élevées ont été observées chez les bovins dans le nord. Chez les porcs, de faibles prévalences ont été observées en générale. Enfin de rares infections à T. congolense savane ont été enregistrées chez les bovins et chez les porcs, seulement la localité de Bouna au nord a enregistré des positifs. Les analyses génétiques de T. congolense ont révelé une importante diversité génétique au sein de cette espèce et sont en faveurs d’une reproduction clonale pour la sous-espèce T. congolense forêt. Aucune corrélation n’a été observée entre la distribution géographique et les paramètres génétiques chez les des deux sous-espèces de T. congolense dans cette étude.