Gut Microbiota Pattern and Kidney Function in Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease Patients in Yaoundé

Abstract

Le microbiote intestinal, qui maintient une relation symbiotique avec son hôte, a récemment été décrit comme présentant des changements dysbiotiques avec le déclin de la fonction rénale dans la maladie rénale chronique (MRC). La MRC a comme première cause génétique la polykystose rénale autosomique dominante (PKRAD), caractérisée par peu de comorbidités susceptibles d'influencer le microbiote. Une étude du microbiote intestinal chez les patients atteints de PKRAD pourrait répondre à la nécessité d'améliorer les efforts de prévention dans la gestion de la MRC grâce à des acides gras à chaîne courte dérivés du microbiote ayant un effet rénoprotecteur. Objectif : évaluer le profil du microbiote intestinal et la fonction rénale des patients atteints de PKRAD. Méthode : Nous avons mené une étude de cohorte historique incluant des individus atteints de PKRAD ayant consulté au Centre Hospitalier et Universitaire de Yaoundé (CHUY) et à l'Hôpital Général de Yaoundé (HGY). Le groupe PKRAD a été apparié pour l'âge et le sexe à un groupe de témoin sain (TS) dans une proportion 2:1. Des données sociodémographiques (âge, sexe), cliniques (tension artérielle, complications, antécédents familiaux et distribution des kystes de la PKRAD), sanguines (créatinine), urinaires (protéines, leucocytes) et fécales (Bifidobacterium, Lactobacillus et Enterobacteriaceae) ont été collectées. Les échantillons de sang et d'urine ont été analysés au laboratoire de biochimie du CHUY. Le débit de filtration glomérulaire estimé (DFGe) était calculé à l'aide de l'équation de la Chronic Kidney Disease Epidemiology Collaboration (CKD-EPI) basée sur la créatinine sérique. Les échantillons de selles ont été conservés et analysés au Laboratoire Vétérinaire National de Yaoundé. L'analyse du microbiote a consisté en une extraction d'ADN et une quantification par PCR en temps réel des cibles mentionnées ci-dessus. Les données ont été analysées à l'aide du logiciel IBM-SPSS. La significativité statistique a été fixée à p < 0,05. Résultats : Nous avons recruté 44 participants (65,9% de femmes) avec un âge moyen de 40,6±11,9 (20 - 65) ans parmi lesquels 29 souffraient de PKRAD. En ce qui concerne les patients atteints de PKRAD, 18 (62,1 %) avaient des douleurs au flanc, 14 (48,3 %) souffraient d'hypertension, 17 (58,8 %) avaient des antécédents familiaux de PKRAD, 11 (37,9 %) avaient des kystes extrarénaux et 11 (38 %) étaient atteints de MRC G3-5. Le DFGe médian était de 74,4 [51,2-94,6] ml/min/1,73m2 et de 94,5 [77,3-111,7] ml/min/1,73m2 respectivement pour PKRAD et TS (p = 0,022). Tous les échantillons de selles contenaient la famille des Enterobacteriaceae, tandis que Lactobacillus et Bifidobacterium étaient absents dans 2 (100% PKRAD) et 10 (60% PKRAD) respectivement. Les Lactobacillus étaient moins abondants chez le groupe PKRAD avec MRC G3-5 que chez le groupe MRC G1-2 (p=0,047) et TS (p=0,043), tandis que les Enterobacteriaceae étaient significativement plus abondantes dans le groupe PKRAD avec MRC G3-5 que dans le groupe avec MRC G1-2 (p=0,048) et TS (p=0,045). Aucune différence n'a été observée entre les groupes et les sous-groupes pour Bifidobacterium. Conclusion : Une diminution du symbiote Lactobacillus et une augmentation du pathobionte Enterobacteriaceae ont été observées avec la baisse de la fonction rénale dans la population PKRAD.