Résistance à quelques antimicrobiens des entérobactéries isolées des eaux superficielles et souterraines à Yaoundé, et importance de certains facteurs abiotique

Abstract

La prolifération des bactéries résistantes aux agents antimicrobiens constitue l’un des plus grands fléaux sanitaires au monde et les entérobactéries figurent parmi les plus redoutables fréquemment rencontrées dans les effluents hospitaliers. La présente étude vise à déterminer la diversité et la dynamique d’abondance des entérobactéries dans certains biotopes aquatiques de Yaoundé, leur susceptibilité vis-à-vis de quelques agents antimicrobiens et l’influence des paramètres environnementaux sur cette susceptibilité. Les échantillonnages d’eau ont été réalisés à la fréquence mensuelle pendant 13 mois, et 18 points de prélèvement ont été choisis et repartis comme suit : 4 points de rejet provenant des stations d’épuration d’eaux usées, 9 points sur les cours d’eau recevant les rejets des stations d’épuration précédentes et 5 points provenant des eaux souterraines situées à proximité des stations d’épuration. Les analyses ont porté sur l’isolement des entérobactéries par la méthode classique d’étalement en surface sur milieux de culture spécifiques et leur identification par les tests biochimiques classiques et sur galerie API 20 . Les tests d’antibiogramme par les méthodes de diffusion de disque sur la gélose Müller-Hinton et de microdilution ont été réalisés. Les paramètres physico-chimiques des échantillons d’eau ont été analysés à l’aide des appareillages appropriés. Les comparaisons des abondances bactériennes ainsi que le rôle des facteurs abiotiques sur leur susceptibilité aux antibiotiques ont été faites à l’aide des tests appropriés. Il en ressort que les abondances des entérobactéries E 4 UFC/100 mL dans les cours d’eau, et de 0 à 122 x10 UFC/100 mL dans les eaux souterraines. Un total de 7 genres (Citrobacter, Enterobacter, Escherichia, Klebsiella, Proteus, Salmonella et Shigella) et de 17 espèces (Citrobacter diversus, Citrobacter freundii, Enterobacter aerogenes, Enterobacter agglomerans, Enteroobacter cloacae, Escherichia coli, Klebsiella oxytoca, Klebsiella ozaenae, Klebsiella pneumonia, Proteus mirabilis, Proteus rettgeri, Proteus vulgaris, Salmonella typhi, Shigella boydii, Shigella dysenteriae, Shigella flexneri, et Shiglla sonnei) ont été identifiés dans les différents biotopes aquatiques. Parmi ces entérobactéries, le genre Shigella et l’espèce Shigella sonnei sont les plus abondantes dans tous les milieux aquatiques étudiés. Le test de comparaison « H » de Kruskal-Wallis a montré qu’il existe des différences significatives (P<0,05) entre les abondances des espèces de la famille des Enterobacteriaceae dans les 3 biotopes aquatiques. Une similarité de l’ordre de 87,45% a été notée entre les eaux usées et les cours d’eau. Les antibiogrammes ont montré que les souches des différentes espèces d’entérobactéries

expriment des résistances à l’ensemble des antibiotiques des familles des β-lactamines, Quinolones, Aminoglycosides et des Sulfamides. Les pourcentages de résistance des entérobactéries aux familles d’antibiotiques ont varié de 93,12% à 98,48% vis-à-vis des β- lactamines, de 93,08% à 98,48% contre les Quinolones, de 79,48% à 89,28% contre les Aminoglycosides, et de 91,26% à 94,49% vis-à-vis des Sulfamides et autres. Les souches isolées ont été multirésistantes, et l’index de multirésistance a varié de 0,91 à 0,95 pour les espèces isolées des eaux usées ; de 0,65 à 0,92 pour les espèces des cours d’eau ; et de 0,65 à 0,81 pour celles des eaux souterraines. Les phénotypes de résistance aux β- lactamines observés ont été les β-lactamases à Spectre Elargi, les Temoneira Bêta-lactamase, les Pénicillinases de bas et de Haut Niveau, les Céphalosporinases de Bas et de Haut Niveau. La Concentration Minimale Inhibitrice de l’Amoxicilline+acide clavulanique, du Ceftriaxone, de la Norfloxacine, de la Ciprofloxacine, de la Gentamicine et du Triméthoprime/Sulfaméthoxazole a été de 39,06 µg/mL sur les souches isolées des eaux usées et des cours d’eau, et a varié de 2,44 à 19,53 µg/mL sur les espèces isolées des eaux souterraines. Cependant, celle des flavonoïdes a été de 125 µg/mL sur toutes les souches testées. Avec la combinaison du Bromo-Chloro-Flavone et de la Gentamicine, la concentration fractionnelle inhibitrice a été de 0,37 µg/mL. Des corrélations significatives (P<0,05) ont été observées entre les paramètres physico-chimiques considérés et les diamètres d’inhibition des antibiotiques, montrant ainsi l’influence des facteurs abiotiques sur la susceptibilité des entérobactéries aux antibiotiques.