Prévalence et diversité génétique des virus des hépatites B (VHB) et D (VHD) chez les populations humaines, et les primates non humains du Cameroun : transmission inter-espèce

Abstract

Les virus des hépatites B (VHB) et D (VHD) sont endémiques en Afrique subsaharienne avec cependant, peu d’informations disponibles sur leur origine, leur circulation et leur diversité génétique. Notre étude visait à déterminer la séroprévalence, étudier la diversité génétique et la transmission inter espèce des VHB et VHD au sein des populations pygmées, des porteurs chroniques VHB et des primates non humains (PNH) dont les grands singes et les petits singes du Cameroun. Le dépistage de ces infections a été réalisé sur les plasmas en recherchant respectivement les antigènes de surface du VHB (AgHBs) et les anticorps dirigés contre l’antigène D (Ac AgD) par la technique « Enzyme Linked Immunosorbent Assay » (ELISA). La diversité génétique et la transmission inter espèce ont été étudiées grâce aux techniques de « Polymerase Chain Reaction » (PCR), séquençage et analyses phylogénétiques des séquences nucléotidiques partielles et complètes. Une séroprévalence de 11.8% du VHB a été trouvée chez les Pygmées. Pour le VHD, des taux de séroprévalences de 17.6% chez les porteurs chroniques VHB et 69.2% chez les pygmées ont été obtenus ; montrant une hyper endémicité des VHB et VHD au Cameroun. Une importante diversité génétique des VHB et VHD a été obtenue. Pour le VHB, des génotypes A et E ont été identifiés chez les pygmées et les porteurs chroniques VHB tandis que des souches recombinantes (AE) ont été identifiées uniquement chez les porteurs chroniques VHB. Pour le VHD, les génotypes 1, 4, 5 et 7 ont été identifiés chez les porteurs chroniques VHB et les génotypes 1, 7 et des souches recombinantes (1 et 7) chez les pygmées. Chez les PNH, une séroprévalence globale de 5.2% a été obtenue pour le VHB. Les VHB typiquement simiens (gorilles, chimpanzés) et un virus recombinant entre les VHB infectant les sous-espèces de chimpanzés Pan troglodytes troglodytes et Pan troglodytes Vellerosus ont été identifiés. Le génome complet VHB détecté chez un Cercopithecus torquatus s’est révélé être proche de celui des Chimpanzés. Certains VHB humains de génotype E et VHB identifiés chez les petits singes se sont regroupés au sein d’un même cluster. Ces résultats suggèrent une transmission du VHB entre les sous espèces, espèces des PNH et des humains. Nos résultats montrent la complexité épidémiologique des infections par le VHB et le VHD au Cameroun liée probablement à l’endémicité, à la grande variabilité génétique, à la diversité des modes de transmission et d’évolution de ces virus au sein des populations humaines et simiennes. Des études supplémentaires permettant de comprendre la dynamique de transmission du VHB entre les humains et les petits singes sont indispensables.