Chimie, Santé et Environnement : Pollution lagunaire, persistance et détection d’entérovirus dans les eaux usées à Abidjan (Côte d’Ivoire)

Abstract

Justification Les travaux de cette thèse s’inscrivent dans la problématique de la contamination virologique des eaux usées et des milieux aquatiques récepteurs. Les entérovirus, en tant que polluants biologiques majeurs, occupent une place importante en santé publique. Leur détection dans les eaux usées constitue un outil efficace pour suivre la circulation interhumaine des virus responsables de paralysies flasques aiguës et pour évaluer le risque d’infection auquel sont exposées les populations. Objectif L’objectif principal de cette thèse est de contribuer à la connaissance de la diversité des entérovirus isolés des eaux usées à Abidjan et d’étudier leur persistance sous l’influence des facteurs environnementaux. Matériel et méthodes Les échantillons d’eaux usées ont été collectés à neuf sites de prélèvement le long d’un canal collecteur débouchant sur la lagune Ébrié, dans la commune de Yopougon à Abidjan. Les analyses physicochimiques ont été réalisées selon les normes AFNOR, le système OxiTop et la méthode HACH 8051 validée par l’US EPA. La concentration et l’identification des entérovirus ont suivi les protocoles recommandés par l’OMS dans les Guidelines for environmental surveillance of poliovirus circulation et le Polio laboratory manual. Résultats La caractérisation physicochimique a permis d’évaluer l’effet des variations hydro climatiques sur la teneur en matières organiques oxydables et particulaires, ainsi que sur le comportement des éléments nutritifs dans les eaux lagunaires réceptrices. La prévalence des entérovirus (EV) dans les eaux usées brutes et lagunaires était de 51,47 % (35/68), dont 48,52 % (33/68) d’entérovirus non polio (ENPV). Le typage des souches a révélé 8 % de coxsackievirus B, 15 % d’échovirus (E7 et E30), 77 % d’ENPV non typables par méthode conventionnelle et 5,71 % de poliovirus de type 2 vaccinal (Sabin-like). La concentration virale moyenne estimée dans les eaux usées brutes atteignait 4,28 × 10⁵ ufp/L. Les entérovirus infectieux ont été détectés en milieu lagunaire pour des températures comprises entre 26 °C et 30 °C. Conclusion Ces travaux peuvent servir de modèle à une étude plus large sur la surveillance environnementale des entérovirus (poliovirus et ENPV) en Côte d’Ivoire. Ils apportent des éléments utiles pour la mise en place de méthodes d’élimination adaptées de ces pathogènes et contribuent à la lutte contre les maladies hydriques liées au péril fécal.